Se você não remover os programas corretamente de alguma forma, eles serão removidos menos completamente. (programas nem sempre são removidos completamente para começar).
Se você excluiu programas no local "arquivos de programa", os itens no registro, os appdata, os appdata do usuário, os drivers e os possíveis dados do "instalador" não serão removidos. Mais outros locais dependendo.
Isso não impediria o funcionamento do sistema operacional, o que causaria poucos danos aos programas que não foram afetados (ainda funcionando). A maioria das vezes deixaria pequenas bagunças por todo o computador, as mesmas bagunças que podem atrasar o computador um pouco, instalá-las e ocupar algum espaço de armazenamento.
"Sub-sistemas" muito importantes do sistema operacional que não são mais totalmente instalados podem afetar a operação de programas que dependem desses subsistemas.
a Remoção de "Arquivos comuns" pode remover itens suficientes de alguns programas que esses programas não funcionariam mais.
No ADD / Remove, muitos programas removidos dessa maneira não seriam totalmente desinstalados via add / remove depois de extrair os arquivos dos Arquivos de Programas.
Adicione / remova a remoção da entrada Adicionar / remover, pois o "instalador não encontrado" não limpará as partes e peças que sobraram.
Possíveis formas de tentar "corrigir":
Volte a colocar os ficheiros ou volte a colocar os ficheiros a partir de uma cópia de segurança.
Reinstale os programas, alguns deles acharão que ainda estão instalados, o que pode exigir muito mais esforço para reinstalá-los, limpando algo primeiro.
Se a intenção for desinstalá-los, reinstalá-los e, em seguida, desinstalá-los corretamente, a maioria os removerá corretamente.
Conclua manualmente a desinstalação: Tente limpar o registro e todos os locais em que as partes e peças do programa se encontram, para concluir a desinstalação. Para alguns programas isso levaria alguns minutos, para alguns isso levaria horas.
Desista da coisa toda e aproveite essa oportunidade para reinstalar todo o sistema operacional e os programas do zero.
Deixe a bagunça, e reinstale os programas que você realmente precisa, se preocupe com a reinstalação da próxima vez que for reinstalar de qualquer maneira, se você fizer isso de qualquer maneira eventualmente. Se algo específico falhar, preocupe-se em reinstalar essas coisas.
O que eu faria pelo meu próprio sistema dependeria do que foi excluído de lá.