É uma limitação do sistema operacional. Não há suporte para aplicativos para colocar janelas em um espaço específico. No entanto, no Mac OS X Lion, você pode usar Continuar. Se você sair do Terminal com as janelas ainda abertas, na próxima vez que você abri-lo, todas as janelas serão restauradas nos espaços apropriados (incluindo as janelas de tela inteira).