Experimente scp -r . Deve fazer o truque.
Estou usando o PuTTY. Eu estou tentando copiar uma pasta de um servidor para outro servidor no Linux. Mas estou recebendo esse erro para o console do PuTTY como
myfolder: Not a regular file
É possível copiar uma pasta usando scp ?
Funcionou em um arquivo zip quando tentei anteriormente.