Essencialmente, não parece haver um programa para fazer o que você procura, mas você pode desativar completamente o uso de dispositivos de armazenamento USB.
De aqui :
Type regedit in RUN dialog box and press Enter. Now goto:
HKEY_LOCAL_MACHINE\SYSTEM\CurrentControlSet\Services\UsbStor
In right-side pane, change value of "Start" to 4
Reset your computer
Depois de fazer isso, você não poderá mais detectar ou montar dispositivos de armazenamento USB. Se você quiser colocar isso de volta ao modo como foi, altere o valor de "Start" de volta para 3.
Você também pode usar o Editor de políticas de grupo para desativar os dispositivos de armazenamento USB.