Eu não recomendaria isso. Não apenas você teria que reinicializar a mesma máquina com a qual está desenvolvendo (interrompendo seu fluxo de trabalho), mas você pode acidentalmente construir um kernel que está faltando alguns drivers de hardware que seu laptop usa.
Se você fizer isso, você pode manter pressionada a tecla Shift durante a inicialização para obter o menu grub e inicializar um kernel oficial em vez do seu personalizado. Então você não estragará nada.
Mas eu recomendo usar uma máquina virtual como VirtualBox ou kvm para inicializar seu kernel em uma máquina falsa e segura.