Na minha opinião, é a abordagem errada para ter a classificação feita pelo cliente. Idealmente, o correio deve ser classificado pelo servidor quando chegar (ou seja, não ser colocado em sua caixa de entrada, mas em outro lugar).
Uma configuração que executa bem essa tarefa é o dovecot MDA com suporte a peneira - a peneira é um protocolo que permite que cada usuário grave um arquivo de regras que será usado pelo servidor para classificar as mensagens na chegada. Os clientes podem entrar em contato com o serviço de peneira para editar as regras. Existe um plugin para o Thunderbird aqui , o webmail do RoundCube também tem suporte para ele:
