Não sabe qual é o seu objetivo, mas já tentou o WMCTRL? Apenas instalei, não tentei - dê uma chance :) (Está no repositório Debian Wheezy, não sei qual distro você está usando) GL
Eu vi esta pergunta , mas as respostas não são boas o suficiente para mim, porque eu não tenho um gerenciador de janelas no meu sistema.
Existe uma ferramenta de console que pode ocultar janelas?
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Estou usando xwininfo para obter informações sobre a janela. Dá id janela, e algumas coisas adicionais. Esse id deve ser suficiente para fazer qualquer operação com a janela.
Não sabe qual é o seu objetivo, mas já tentou o WMCTRL? Apenas instalei, não tentei - dê uma chance :) (Está no repositório Debian Wheezy, não sei qual distro você está usando) GL