Bem, como o comentário de @aviv diz (e isso deveria ter sido uma resposta), é seguro excluir esses arquivos.
Gostaria de acrescentar que, em geral, é uma boa ideia usar um diretório de trabalho para fazer essas coisas. Parece que foi um script que baixou e extraiu a fonte, compilou e vinculou as coisas (o que explica os arquivos lo - que são objetos da libtool) e não estava bem comportado o suficiente para limpar depois de si mesmo.
As instruções parecem indicar o seu suposto para criar uma pasta para si, extrair a fonte e basicamente fazer o equivalente de build-dep, pegar os deps, fazer e instalar os arquivos. Diferente de arquivos de barganha em todo o lugar, parece ter feito algo que qualquer usuário experiente faria.
Assumindo que é apenas uma compilação padrão, a execução limpa na pasta pode ter limpado as coisas, já que exclui todos os arquivos vinculados, assumindo que tudo foi deixado lá. Teria tornado a vida um pouco mais fácil.