Se você está tentando restaurar as configurações de fábrica (ou seja, de volta a um Ubuntu limpo), sua melhor opção é inicializar no modo de recuperação e salvar seus dados em outro disco / partição e reinstalar o Ubuntu. O processo levará cerca de uma hora, mas pode ser muito mais fácil do que tentar descobrir o que deu errado com seu sistema operacional atual.
Se você preferir tentar resolver o problema, pode postar um pouco sobre o assunto em questão e a comunidade ficará feliz em dar alguns conselhos.
Uma coisa que eu encontrei com o Linux, é que quando algo dá errado (no meu caso geralmente é uma atualização de driver que não é compatível com minha placa de vídeo), a reinstalação completa do sistema é a solução mais fácil. Se você sabe o que causou o problema, você aprende e pode evitar coisas desse tipo no futuro.