1: Depende do que sua placa-mãe está configurada para inicializar a partir do primeiro. Você precisará ir para a tela do BIOS (antes do Windows iniciar) e verificar se o ssd é o primeiro na ordem de dispositivos de inicialização.
você também pode ter alguma sorte com a execução do "fixboot" no console de reparo. Ele verifica todas as unidades acessíveis para janelas de inicialização e ajuda a colocá-las no carregador de inicialização.
2: Usando o gparted (gerenciador de partições do Ubuntu), você pode fazê-lo alinhar corretamente. Funciona melhor a partir do live cd, já que o gerenciador de partição está disponível no disco sem a necessidade de reinicializar.
Veja isto artigo que se refere a este postagem no fórum .