Você identificou corretamente o que a tabela dinâmica está fazendo, ou seja, calcular a média de todos os itens "João", em vez de calcular a média das médias.
Tenho certeza de que há uma razão formal para isso, mas, aos meus olhos, significa que a média geral não é distorcida, por exemplo, nos casos em que você tem uma observação isolada de um dia, mas muitas observações em outros dias.