Instale e configure o NTP para sincronizar com o (s) seu (s) servidor (es) externo (s). Eu suponho que o NTP já esteja no Windows 2008.
O NTP corrige o tempo em pequenos passos, para que você não perceba e terá sempre a hora certa.
Ou o que você realmente quer dizer com "o tempo não muda enquanto o aplicativo está em execução"? Você quer parar o relógio do sistema? Isso provavelmente não é possível ...