Com relação ao sistema operacional, isso depende do seu sistema operacional. Eu troquei placas-mãe no Linux várias vezes ao longo dos anos e não tive nenhum problema além de uma vez quando a enumeração de unidade mudou devido ao controlador de E / S diferente, mas isso foi fácil de corrigir a partir de um LiveCD. Eu nunca usei hardware ou firmware RAID nesses casos (o software RAID do Linux, como você esperaria do software RAID, sobrevive à mudança sem nem perceber). O Windows tem sido tradicionalmente muito mais problemático nestas circunstâncias, embora eu tenha dito que as versões mais recentes não são tão propensas a falhar completamente (se você pode chegar ao modo de segurança, geralmente pode recuperar todo o resto baixando os drivers relevantes através de outra máquina ).
Portanto, no seu caso, além de obter exatamente a mesma placa-mãe, a única coisa que você pode fazer para ter certeza é se certificar de que seus backups estão atualizados e testá-lo.