A melhor ferramenta que conheço para analisar e corrigir problemas de baixo nível nos formatos dos / windows & ambientes é: link
Se isso não resolver o problema, você provavelmente terá uma falha de hardware em suas mãos. Eu altamente, recomendo fazer backup de qualquer coisa / tudo que você puder antes de executar qualquer software de análise / recuperação. Na minha experiência com falhas de hardware eles ficam cada vez pior quanto mais o disco roda, então você tem uma quantidade limitada de tempo em que a unidade está ligada para obter coisas. NÃO escreva nada no disco - leia / copie só. Em seguida, experimente o spinrite para ver se você pode consertar as coisas dessa maneira. Às vezes é apenas um setor ruim que surge e que não compromete todo o disco ..