Você pode usar dot2tex
para traduzir Graphviz arquivos em comandos PSTricks ou PGF / TikZ. Você pode até escrever diretamente no código-fonte do LaTeX com o pacote dot2texi , < a href="http://www.fauskes.net/code/dot2tex/documentation/#the-dot2texi-latex-package"> aqui é um exemplo.
De qualquer forma, Graphviz é capaz de produzir vários formatos (ps, svg, etc.).
Tudo o que você precisa fazer é aprender a sintaxe DOT language (usada por Graphviz ), mas há muitos exemplos disponíveis.
Não tenho certeza se isso atende às suas necessidades especiais, mas talvez valha a pena tentar.