O NTFS não suporta permissões * nix. O que você está tentando fazer não funcionará. Você pode montar todo o volume NTFS como um determinado usuário e grupo através de opções de montagem.
Estou trabalhando em um aplicativo django no Ubuntu 9.10, e tenho os arquivos armazenados em uma partição NTFS (porque eu tenho inicialização dupla e, infelizmente, ainda tenho que fazer algumas coisas com o Windows). Testá-lo com o django toy server estava indo bem, mas quando tentei testá-lo com o apache, encontrei um problema: tentei alterar o grupo dos arquivos para www-data, mas as mudanças não pareciam ter efeito ! Isso significa que eu terei que copiar meu projeto todo para uma partição ext [34] se eu quiser usar o apache? Isso não parece tão bom ... Existe uma maneira de fazer isso, usar chgrp ou qualquer outro comando e deixar www-data executar meus módulos python armazenados na partição NTFS?