Quando inicializo o Ubuntu do meu disco rígido USB, ele diz "Missing Boot MNGR". Apenas inicializa a partir de CDs e DVDs.
Este é um Acer Aspire com o gerenciador de boot do Windows 7.
Parece que seu sistema está tentando inicializar o setor de inicialização do disco rígido USB, mas o disco rígido não tem o grub ou outro gerenciador de inicialização instalado. Você já tentou usar o disco super grub (é um download para um CD que deve funcionar bem) para tentar inicializar a partir daí?
link para o SGD: link
Você já viu este guia?
Parece muito fácil, mas parece que você precisa do Windows para executar esse utilitário inicialmente. Pelo que parece, você tem o Windows, então não acho que isso seja um problema.