É tão simples quanto ir ao prompt de comando (com elevação; start -> search for 'cmd' -> right click -> "run as administrator" ) e digitar chkdsk /x /r D: (substituindo D: pela unidade que você deseja verificar.) O parâmetro /x força uma desmontagem da unidade e o parâmetro /r força uma varredura de superfície do inversor. Espero que ajude!