A maneira mais fácil de fazer isso é criar dois arquivos em lote e colocar links para eles no menu Iniciar. É possível criar atalhos para cada um deles, tornando-o mais acessível.
O lote para parar o Intellitype deve conter o seguinte comando:
taskkill /IM itype.exe /T /F
O lote para recarregar o Intellitype deve executar o itype.exe e, dependendo da localização do itype.exe, ele deve conter:
"c:\Program Files\Microsoft IntelliType Pro\itype.exe"
Por favor, note que estes foram testados apenas no Windows 7.