Os favoritos da AFAIK que aparecem na raiz não estão marcados.
Você pode criar um marcador chamado "Todos" e atribuí-lo a todos os favoritos, criando assim uma pasta que contenha todos os favoritos.
Eu tenho usado o fabuloso recurso de favoritos na barra de ferramentas do Google. A etiquetagem do marcador permite que o marcador apareça em mais de uma pasta de etiquetas.
Eu estou querendo saber se eu posso rotular um marcador para aparecer tanto na raiz (padrão para nenhum rótulo), bem como dentro de pelo menos uma outra pasta de etiqueta. Pode-se perguntar por que você precisa "escondê-lo" em outra pasta quando está na raiz. Meu motivo é simples, quero rotular tudo por uma questão de organização.