Eu encontrei uma maneira que (principalmente) funcionou:
* Limpar instalar o Windows
* Inicialize no console de recuperação
* Exclua todas as pastas que estão presentes dentro de Windows.old, isto inclui Windows, ProgramData, Usuários, Arquivos de Programas, ...
* Copie tudo do Windows.old (do backup em outra unidade) para o disco em que o Windows está instalado usando robocopy
. O comando que usei é o seguinte (sendo F a unidade de backup e G a unidade do Windows):
robocopy F:\Windows.old G:\ /E /COPYALL /SEC /DCOPY:DAT /SL /R:0 /W:1 /LOG:G:\copy.log /TEE /NP /EFSRAW