Basta adicionar à sua variável $ PATH (definida pelo usuário ou global, como você quiser) o diretório no qual deseja que o Windows inicie os programas.
Existe uma maneira de dizer ao Windows Run Diálogo ( Win-R ) para iniciar programas em uma pasta diferente de C:\Users\<username>\
?
Basta adicionar à sua variável $ PATH (definida pelo usuário ou global, como você quiser) o diretório no qual deseja que o Windows inicie os programas.
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