Essas configurações são persistentes, mas são definidas por "Location". Além disso, a hierarquia da GUI pode dar a impressão enganosa de que eles são por interface, mas há realmente apenas um conjunto de servidores DNS que se aplica a todas as interfaces.
Então, se você estiver trocando "Locais" ou editando "configurações de DNS de outras interfaces", você mesmo a alterou acidentalmente.
Também é possível que outro processo no seu sistema esteja alterando o banco de dados de configuração do sistema pelas suas costas. Eu olharia o que VPN ou software de segurança você instalou. Talvez o seu software VPN corporativo esteja tentando garantir que suas consultas ao DNS acessem o servidor DNS interno para que você possa resolver nomes de host de escopo interno. Talvez não esteja restaurando sua preferência quando o túnel VPN desce inesperadamente.