Verifique novamente seu python ! Pode não ser a versão que você espera. No meu sistema, python foi linkado simbolicamente para python3.5 , mesmo que sys-apps/portage (que fornece o pacote portage Python) ainda não tivesse um destino para o Python 3.5. Argh!
Nesse ponto, você não poderá recompilar portage com destinos diferentes (porque emerge está corrompido), portanto, verifique todas as versões do Python instaladas (ou procure por $EPREFIX/usr/lib/python*/site-packages ) até encontrar um com um pacote portage . Se você tem um eselect de trabalho (eu fiz), você pode usá-lo (ver eselect python help ); senão, você pode provavelmente escapar apenas alterando manualmente o symlink. Portage funcionou bem para mim depois disso.
Quanto ao bootstrap de prefixo… parece que se você simplesmente executar o script interativamente novamente, ele começará tudo de novo, desde o começo. Eu não queria começar de novo, então mudei para o processo de bootstrap "manual" e peguei no terceiro estágio, onde o script falhou. Eu realmente não tenho certeza porque este método é recomendado contra, dado que o script de bootstrapping faz todo o trabalho, assim como no método recomendado.