Eu tive esse problema há alguns dias.
Isso estava me enlouquecendo, pois parecia que a única maneira de ter certeza de colocar o disco de volta on-line era reinicializar o PC.
A solução para mim foi conectá-lo a um Hub USB Powered.
Anteriormente, ele foi conectado diretamente a uma porta USB frontal.
No meu caso, é uma unidade Slim Seagate de 2 TB que é alimentada somente através de USB.
Um 'Magic' Drive, nunca aquece e é totalmente silencioso em operação.
Desde o swap-over para um Powered Hub, eu não tive um único problema com ele, e a paz voltou!
No seu caso, pode não fazer diferença, com a sua própria fonte de energia externa, mas vale a pena tentar, mesmo que apenas pela tranquilidade que pode acontecer!