Eu não acho que o seu disco rígido está fazendo esse som. Fazer algo no computador, como excluir ou preencher espaço, não afeta o disco rígido, apenas se o disco rígido estiver cheio, mas, de qualquer forma, provavelmente é o ventilador da sua CPU. Tente abrir o computador e limpe cuidadosamente a poeira do seu ventilador.