sed --version mostra 4.2.1 e eu verifiquei se o gnuwin32 não é do cygwin.
Isso cria um arquivo a.a com uma citação
C:\blah>copy con a.a
"^Z
Overwrite a.a? (Yes/No/All): y
1 file(s) copied.
C:\blah>cat a.a
"
C:\blah>sed "s/\"/Q/" a.a
Q
ecoar uma citação é um pouco engraçado, mas isso pode ser feito com ^"
C:\blah>echo " | sed "s/\"/Q/"
" | sed "s/\"/Q/"
C:\blah>echo ^" | sed "s/\"/Q/"
Q
Mas você nem precisa cercar toda a expressão de substituição de sed com aspas
C:\blah>echo ^" | sed s/\"/Q/
Q
C:\blah>sed s/\"/Q/ a.a
Q
C:\blah>