Atualização: para qualquer um que encontre isso em uma pesquisa na web, sugiro usar o NextCloud e o Disroot.org, em vez do OC e do OMB.
Você pode usar o ownCloud. O software do lado do servidor é o AGPLv3 e existe um cliente CLI que é GPL . Se você não tem seu próprio servidor, ou está com pressa, você pode configurar uma conta gratuita no OpenMailBox.org, que inclui acesso ao seu próprio servidor. O OMB usa apenas software livre, como confirmado pela FSF em sua página 'Free Software Webmail Systems'.