Nah, você pode ter certeza de que o vírus não lerá nenhum dado, a menos que as configurações tenham sido feitas. Primeiro, precisamos saber qual software você usa para esse ambiente virtual. Eu aconselharia usando caixa virtual. E para sua pergunta, na caixa virtual, existe uma configuração que permite especificar algumas pastas no disco rígido para serem montadas em vd, para que você possa visualizar o software presente nessas pastas / unidades. Isso você pode definir para ler e escrever ou apenas para ler. Mas em ambos os casos, se o vírus estiver presente nessa pasta, há poucas chances de que ele possa se espalhar dentro do vd, mas não tanto quanto a maioria dos vírus tem seus executáveis na pasta de inicialização, para que possam ser iniciados automaticamente quando o Windows começa, mas ainda depende do tipo de vírus, como o que ativa com um arquivo ou pasta. Existem muitos tipos, mas há também uma coisa a notar que os vírus no Windows são todos executáveis, ou compatíveis apenas com Windows, eles não seriam compatíveis com o Linux, caso em que se houver algum vírus, na pasta seria apenas mostrá-lo, que no caso do windows seria oculto.
Assim, você pode ter 99,99% de certeza de que não haverá problemas com o uso do Linux no Windows Host, pois eu mesmo usei o Windows 8, no Windows 7 como host, cheio de vírus e malware, que até o O Windows Defender não detectaria nenhum vírus, mas quando eu usei o W8 no VB, não havia problema algum.