Após clonar sua unidade, você pode reformatá-la e usá-la como uma unidade adicional, desde que sua placa-mãe tenha portas sata suficientes (o que provavelmente é necessário). Também tenha em mente que os SSDs maiores são mais rápidos.
BTW, não se esqueça de mudar de qual drive você está inicializando, como @Journeyman Geek ♦ mencionado.
A formatação do SSD normalmente é boa, desde que você não tenha dados confidenciais que não deseja que outras pessoas recuperem.