O comando apache que você tentou é claramente o problema, fez com que todos os tipos de arquivos agora pertencessem a www-data em vez de root, seu usuário e um monte de outros usuários do sistema que operam a máquina.
Seria muito difícil tentar recuperar a máquina em seu estado atual e, em vez disso, a melhor ação a ser tomada é reinstalar. Certifique-se de fazer backup de todos os seus arquivos primeiro, inicializando um liveCD ou liveUSB. Você pode precisar de outra máquina para fazer o equipamento necessário para a recuperação.
Se você estiver com dificuldades, procure um funcionário local do Ubuntu que possa ajudar. Existem empresas que oferecem manutenção agora, bem como indivíduos de equipes LoCo em todo o mundo.