Você está confundindo o Windows 8 com o Windows RT (que é uma variante da família Windows 8), que está sendo executado alguns tablets com processadores ARM, que não podem executar aplicativos Win32 (todos os habituais), apenas aplicativos da Windows Store, que na verdade é uma plataforma fechada, semelhante ao Apple iOS.
O Windows 8 e o Windows 8 Pro podem executar aplicativos Win32 e aplicativos da Windows Store, então você está bem.