As versões pagas oferecem mais recursos (ou seja, o fantoche oferece uma maneira mais fácil de implantar uma massa) e, em muitos casos, o mais importante, é o suporte pago. Ao executar servidores corporativos, ter o suporte pago para ajudá-lo a configurar normalmente vale a pena, especialmente quando você se depara com problemas.
Normalmente, você não vai errar com as versões gratuitas ... só se precisar de ajuda para começar a trabalhar, ou simplesmente tem uma infraestrutura tão grande (e pouca experiência com o gerenciamento de configurações).