É um problema simples de gerenciamento de chaves. Não há nada tecnicamente que impeça você de usar a mesma chave de vários locais. Você pode até usá-los ao mesmo tempo. No entanto, usar a mesma chave para vários sistemas torna a revogação mais dolorosa. Também limita o rastreamento de usuário que você pode fazer.
Permitir que um usuário use a mesma chave de todos os sistemas dele é uma configuração comum e o que eu recomendaria. Se os usuários têm acesso root, é muito difícil impedi-los de mover as chaves de qualquer maneira.
Apenas certifique-se de não cair na armadilha de usar uma única chave para todos os seus usuários. Isso dói quando alguém esquece um laptop na China.