Veja a barra de ferramentas a partir da esquerda e localize o ícone mais à direita.
Clique no ícone (ícone de lápis na captura de tela), depois aparecerá outra barra de ferramentas e mostrará mais dois ícones para adicionar "anotação de texto" e "realçar anotação".
Usando anotações no Evince
O Evince Document Viewer tem uma interface de usuário um pouco diferente, dependendo de quais disponíveis pacote de Evince em uso. O ícone de anotação está localizado no menu da barra de ferramentas (versão mais recente, acima) ou no menu da barra lateral (versão mais antiga, abaixo).
Compatibilidade de anotações
Eu testei e confirmei que o arquivo PDF anotado que foi criado na versão mais recente pode ser aberto e visto de forma semelhante na versão anterior. No entanto:
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o texto que foi adicionado a qualquer anotação de destaque não será visível nem editável (compare as capturas de tela acima para ver a diferença)
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versão antiga do Evince permite adicionar e modificar "anotação de texto", mas não pode removê-lo
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o recurso "anotação de destaque" não está disponível para a versão anterior do Evince, por exemplo,
3.10.3-0ubuntu10
no Xubuntu Trusty (14.04)
TL; DR O ícone de anotação já existe.
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