Os arquivos encontrados nada mais são do que links simbólicos para metadados de programas instalados. Como Serg explicou os aplicativos usando o centro de software vão para a pasta descrita. Eles não são programas reais, mas apenas um ponto onde o sistema pode armazenar em cache para uso mais rápido da próxima vez. É mais eficaz e eficiente ter um sistema para reunir todos os programas e criar meta-arquivos e vinculá-los simbolicamente em uma área.
Mas o Ubuntu usa dois gerenciadores de pacotes separados. Uma é a de que um é o centro de software. Isso, por sua vez, cria sistemas de arquivos de pacotes separados. É assim que o Ubuntu lida com isso, mas ao invés de jogar tudo junto, os dois sistemas agem como um casal. Ambos se comunicam para ver o que está lá, ambos têm acesso root a ambos, mas eles não compartilham quais programas são instalados um pelo outro