O Webmin é uma interface de administração baseada em Perl (não baseada no Apache) que, ao contrário do cPanel, permite controlar todos os aspectos do seu servidor, visualmente ou manualmente, através do uso de formulários da web. Ele também possui um gerenciador de arquivos java que lhe permite ter uma idéia visual do que está em seus HDDs e pode realizar operações básicas de arquivos neles. Em termos de segurança, você pode restringir o acesso à sua interface especificando uma lista de IPs ou classes de IPs.
Se você pretende manipular vários domínios, o Virtualmin (é um módulo para o Webmin) é a melhor escolha, pois permite gerenciar um domínio de forma centralizada, ou seja, cuida automaticamente de zonas DNS, aliases de e-mail e Vhosts do Apache. Claro, você pode ajustar o BIND, o Apache e o servidor de e-mail usando a configuração visual de / ou a configuração manual.
Se você pretende dar acesso a outros usuários, o Usermin é uma boa escolha, pois permite que usuários comuns acessem o servidor SQL, servidor de e-mail e muito mais, mas tenha cuidado com os módulos ativados, ou seja, não habilite módulos a menos que você pretenda usá-los.
Suporte: O Webmin oferece um bom suporte para o Ubuntu e pode fornecer boas informações sobre pacotes desatualizados, além da possibilidade de atualizá-los. Ele também possui alguns módulos que foram especialmente projetados para tarefas de administração do Ubuntu.