Um identificador de processo é um valor inteiro que identifica um processo para o Windows. A API do Win32 os chama de HANDLE; alças para windows são chamadas HWND e manipulam para módulos HMODULE.
Threads dentro de processos têm um identificador de thread, e arquivos e outros recursos (como chaves de registro) também têm identificadores.
A contagem de identificadores que você vê no Gerenciador de Tarefas é " o número de identificadores de objeto na tabela de objetos do processo ". Na verdade, essa é a soma de todas as alças que esse processo abriu.
Se você não liberar seu identificador para um recurso, outras pessoas talvez não consigam acessá-lo - é por isso que às vezes você não pode excluir um arquivo porque o Windows afirma que ele está em uso (confira este artigo sobre vazamentos de identificadores e o Process Explorer ).
Além disso, há um limite por processo em vários identificadores. Aqui está um exemplo .
Em geral, se você estiver abrindo alças e não fechá-las, isso será análogo a vazamentos de memória. Você deve descobrir o que está acontecendo e consertá-lo. Existe um bom artigo CodeProject sobre vazamentos de identificadores .