Esta ação vai contra o propósito do Red Hat Enterprise Linux (e, portanto, do CentOS). Essas distribuições corporativas destinam-se a manter versões secundárias estáveis do kernel e dos pacotes principais (glibc, gcc, etc.) para fornecer uma plataforma estável em todo o ciclo de vida suportado da distribuição.
Isso significa que instalar um kernel muito mais recente transformaria seu sistema em algo outro que o CentOS.
Dito isto, definitivamente pode ser feito. O link que você postou é um bom guia. Você também deve atualizar para o CentOS 6.3 enquanto estiver no processo. (6.4 está a caminho)
Após sua compilação, você deve selecionar o kernel recém-compilado na tela de inicialização do CentOS ou alterar o kernel de inicialização padrão através da linha default=
em /etc/grub.conf
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