Honestamente, vou adiar o ext4 agora para uso em produção.
Existem outras opções se você estiver com problemas reais de desempenho com o sistema de arquivos (e eu posso entender essa situação, no meu último trabalho nós tivemos limitações de desempenho em um aplicativo devido ao ext3). Dependendo da distribuição escolhida, você poderá usar jfs, xfs ou reiserfs. Todos os três geralmente superam o ext3 de maneiras diferentes, e todos os três são muito mais testados e estáveis do que o ext4 agora.
Então, minha recomendação seria de várias partes. Primeiro, investigue cuidadosamente para garantir que você está otimizando no lugar certo. Teste seu aplicativo em diferentes sistemas de arquivos e assegure-se de que o desempenho seja aprimorado o suficiente para tornar uma alteração no sistema de arquivos válida.
Além disso, dependendo da sua aplicação, adicionar mais memória RAM pode melhorar o desempenho. O Linux, por padrão, fará uso de qualquer RAM que não esteja comprometida com aplicativos como cache de disco. Às vezes, ter alguns GB de RAM "não usada" pode ter um aumento significativo de desempenho em caixas com grande atividade de disco.
Finalmente, qual é o seu requisito de cronograma aqui? Se ext3 não estava cortando e eu tive que construir uma máquina com um sistema de arquivos diferente hoje, eu provavelmente usaria xfs ou jfs. Se eu pudesse empurrá-lo por 6-8 meses, eu provavelmente esperaria e veria como o ext4 foi formado.