Você deve começar a partir das páginas Projeto de Documentação do Linux .
Algumas referências interessantes estão listadas aqui.
Mas você deve percorrer esta página de guias e provavelmente também outras páginas no site.
Com base no seu entendimento atual, seria bom selecionar os guias corretos diretamente de lá.
- Introdução ao Linux
- O guia de administradores do Linux - também uma versão em PDF na página principal de guias
- Guia avançado de script Bash - há também uma versão para iniciantes
Assim que você entrar em contato, as páginas do HOWTO deverão ajudar em coisas específicas.