Estou tendo o mesmo problema, mas não passei pela instalação / desinstalação do GNOME 3.10. Eu acho que só veio com a atualização do ubuntu regular. Esse menu de painel de unidade / global é uma dor de cabeça, não sei por que não consigo acertar.
De qualquer forma, isso funciona para mim no GIMP: * abra um terminal e execute: $ killall -HUP unity-panel-service
Isso redefinirá o menu e os itens em cinza ficarão disponíveis. No entanto, quando você inicia o GIMP novamente, ele volta para os menus acinzentados, portanto, você precisa killall novamente.
Espero que isso ajude -H