Consegui resolver esse problema, mas o problema que tive parece ter sido relacionado ao fato de eu ainda ter a configuração do Apache no servidor, e alguma parte do Apache estava em conflito com a capacidade do Nginx de páginas php do servidor, mesmo que o Apache não estivesse em execução.
Se você tiver o mesmo problema, tente remover o Apache, o PHP e todos os módulos relacionados e reinstale o que você precisa.