Você pode instalar qualquer kernel que quiser. Não há problema em usar um ou vários Kernels por vez. Mas em algum momento você deve considerar o Mapeamento do Kernel para a sua versão do Ubuntu. Por exemplo, seguindo o link lista o mapeamento do kernel diferente para a versão diferente do sistema operacional:
Mapeamento da versão do kernel do Ubuntu para o Mainline
Você pode obter informações completas sobre a instalação / remoção do kernel a partir do link a seguir.
Isso me ajudou muito a instalar um novo kernel no Ubuntu 12.04.2. Agora eu posso escolher qualquer kernel 3.5.0 ou 3.8.0 do menu grub.
O link a seguir ilustra como o Ubuntu 12.04 LTS funciona. Ele ilustra de uma maneira muito legal, você também gostaria de:
Pilha de Ativação do Ubuntu LTS
Espero que esta breve descrição ajude você.