Experimente o interruptor de reporte de desativação:
--disablerepo=REPONAME
UPDATE
Para encontrar todos os repositórios atualmente "conhecidos" (ativados e desativados):
yum repolist all
Em seguida, para descobrir qual repositório está causando dor pelo pacote acima, tente:
yum list php53-mcrypt-5.3.3-4.ius.el5.x86_64 --showduplicates
Isto irá mostrar quais dos seus repositórios fornecem o pacote acima (você também verá "installed" na lista, para mostrar os pacotes instalados localmente).
Tente o interruptor de desativação novamente assim que conhecer o repositório usando o switch de repo desativado.
yum update --disablerepo=[from above]
Ao falhar nas etapas acima para destacar o repositório que você deseja omitir, tente dar uma olhada em /etc/yum.repos.d / , que é o Local padrão do RHEL para definições de repositório. Uma vez nesse diretório, localize todos os arquivos de repositório de base e atualizações padrão do RHEL e inclua enabled = 0 , por exemplo,
[repo]
enabled=0
Espero que isso ajude.