Se você quiser que a instância inicie com um ponto de partida fixo sempre que for executada, você poderá:
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Crie sua própria AMI e execute isso como a instância a cada vez ou
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Especifique um script de dados do usuário que instale e configure o software de acordo com suas especificações sempre que uma nova instância for iniciada a partir de uma AMI de base padrão.
Se você precisar manter o estado entre as execuções da instância, precisará salvar os dados em algum lugar fora da instância / AMI. Por exemplo:
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Os dados podem ser mantidos atualizados no S3, SimpleDB, DynamoDB, RDS, etc.
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Você pode designar um volume EBS permanente que a instância anexa dinamicamente e monta na inicialização. Isso pode ser feito com um script de dados do usuário.