Não realmente. Eu tenho 4 servidores Dell PowerEdge empilhados um em cima do outro agora. Não existe realmente o risco de reduzir os servidores de baixo do peso dos servidores de topo e não há realmente o risco de sobreaquecimento, uma vez que os servidores retiram ar fresco pela frente e libertam o ar quente pela parte de trás.
O risco é que a plataforma em que você está colocando pode entrar em colapso se não puder suportar o peso dos servidores. A única outra questão, como salientou jscott, é a incapacidade de acessar as entranhas sem afastá-las umas das outras.