Eu acho que as maiores peças que ainda faltam no Nginx são o suporte total a WebDAV. Praticamente todos os outros aspectos são cobertos pelo núcleo ou por um módulo de terceiros.
O Nginx não suporta coisas como mod_php por design, então não tenho certeza se você pode dizer que o Nginx está faltando essas partes. É mais parecido com o fato de o Nginx estar lhe dizendo com bastante força que usar isso é estúpido.