O servidor sftp do SSH tem alguns requisitos adicionais para diretórios chroot, ie. usuário não pode ter acesso de gravação ao diretório chroot em alguns ambientes, isso pode ser um problema.
Se você também precisa de ftp / ftps, eu sugiro que você ofereça o mod_sftp. Estamos usando isso em produção em cerca de 20 servidores com mais de 10k contas com problemas quase nulos (sftp é o protocolo menos usado). A desvantagem pode ser que ele não suporte o método de autenticação por senha, mas ele suporta rsa key e keyboard-interactive, portanto, é apenas um problema para clientes muito antigos.