Bem, para definir essa fonte para a conta root, você precisa executar a ferramenta Tweak como root e definir a fonte novamente. A conta raiz tem suas próprias configurações, diferentes da sua conta de usuário.
Você não precisa copiar fontes manualmente para locais do sistema, droid
fonts já estão empacotadas para o Ubuntu (pelo menos 12.10), você pode instalá-las digitando o seguinte comando no terminal:
sudo apt-get install fonts-droid